Определение мутации в генах H3F3A, HIST1H3B и HIST1H3С

Белки 3.1 и 3.3 играют важную роль в посттрансляционной эпигенетической регуляции экспрессии генов путем опосредованного изменения гетерохроматиновой структуры ДНК и регуляции взаимодействия активаторов и ингибиторов транскрипции. Мутации в генах HIST1H3B и H3F3A, кодирующих данные белки, наблюдаются в детских злокачественных новообразованиях головного мозга.

Мутации в гене H3F3A встречаются преимущественно в опухолях детей и молодых взрослых (5-23 года). Наиболее типичной локализацией является область средней линии головного мозга (гипоталамус, таламус, перекрест зрительных нервов, мост), однако мутации также могут обнаруживаться и у 2-7,5% взрослых пациентов с астроцитомами и диким типом генов IDH1/2. Мутация гена H3F3A, приводящая к замене K27M встречается в 78% случаев диффузной внутренней глиомы моста и 22% случаев глиобластом за пределами ствола головного мозга. Диффузные внутренние глиомы моста без мутации в гене H3F3A часто демонстрируют мутацию K27M в генах HIST1H3B и HIST1H3C (~10%). Замена глицина на аргинин или валин в 34 положении гена H3F3A встречается в основном при глиомах вблизи мозолистого тела у пациентов в возрасте от 9 до 42 лет.

Мутация K27M в гене H3F3A имеет прогностическое значение и ассоциирована с худшей выживаемостью по сравнению с пациентами, имеющими дикий тип H3F3A и мутацию в гене HIST1H3B. Ряд перспективных исследований in vitro указывают, что эти мутации могут стать мишенями, как для пептидных вакцин, так и для химерных антигенных рецепторов. Также исследование мутации в гене H3F3A было добавлено в рекомендации NCCN 2018 года.

Исследуемые мутации:

H3F3A: K27M, COSM327928

H3F3A: G34R/V COSM327929, NM_002107.4 (H3F3A):c.100G>C (p.Gly34Arg)

HIST1H3B: K27M COSM829202

HIST1H3C: K27M COSM1580151

Метод исследования: прямое автоматическое секвенирование.